质谱流式技术服务
提供从定制化的方案、样本处理、抗体标记、检测上机到数据分析的全流程检测服务
一. 技术原理:
质谱流式细胞技术(Mass Cytometry, CyTOF)采用带有金属同位素标签的抗体对细胞进行标记,通过飞行时间质谱分析各细胞上的标签组成,进行细胞表型和功能的深入研究。
二. 技术特点
超高通道质谱流式具有非常宽的原子量检测范围(80-209 Da),理论上可以同时检测130个通道。
超高性价比单个细胞可同时检测42个Marker,大大节约了实验成本,并减少了实验准备时间。
超高分辨率金属标签替代荧光标签,无串色干扰、无需补偿、背景极低,可深入研究各细胞亚群的功能及细胞亚群间的联系,实现更加精细的细胞分型。
超多维度多样化的数据处理方式,实现对样本的深入数据挖掘。
服务流程
采用多对一的项目合作模式,针对单个项目建立包含多名专业技术人员的专项团队。
深入了解客户需求,从合同签订到结项报告全流程有效沟通并严格质控。提供更加专业、放心的质谱流式完整解决方案。
三. 样本类型
人源样本包括肝癌、肺癌、胃癌等癌组织和斑块、血管、 皮肤等非癌组织。
小鼠样本包括小肠癌、直肠癌、黑色素瘤等癌组织和脑膜,心脏、骨髓等非癌组织。
涉及实体瘤、血液病、自身免疫病、心血管疾病、呼吸系统疾病等多个领域。
四. 数据分析
生信分析团队的核心科学家博士毕业于美国拥有顶级生物医学工程专业 的佐治亚理工学院,核心算法的系列软件均为自主研发,拥有正式授权的软件著作权35项。能够为客户提供定制化的数据挖掘方案,满足多样化的数据分析挖掘需求。
1) heatmap:热图展示经生信算法自动解析的亚群cluster与其marker表达模式。
2)tSNE:降维可视化展示不同cluster、group细胞以及marker表达的空间分布。
3)Frequency bar:不同sample、group的亚群比例叠加图。
4)boxplot:统计学分析出不同group间差异的细胞表型。
5)Correlation:不同cluster、marker间相关性分析。
6)Marker density:展示不同cluster、group间marker的表达分布密度。
7)MST:展示所有细胞亚群及marker的空间相关性分布。
8)Pseudotime:拟时序分析细胞群体发育轨迹。
五. 服务优势
全程可定制化: 国内唯一提供从Panel设计到数据分析全程可定制化的CyTOF完整应用解决方案。
检测通道数: 国际率先实现单细胞40+个蛋白检测通道(目前国内通过为35通道)。
生信团队: 拥有专业的生信分析团队和自主研发的数据分析系统,实现海量数据深度挖掘。
质控标准化: 国内率先实现CyTOF全流程标准化、体系化建设。
项目经验丰富: 已合作开展了数百个不同领域的CyTOF研究项目,项目已覆盖实体瘤、血液病、自身免疫病等多个领域。
六. 问答 Q&A
CyTOF和流式的区别?
简单来说CyTOF就是高通量流式,采用金属同位素标签替代传统流式的荧光标签来标记细胞,并通过飞行时间质谱来检测每个细胞上金属标签的精确含量。和传统流式相比,CyTOF不会存在“串色”的问题,不需要
补偿计算,因此可以同时检测更多种蛋白,目前能够同时测42个marker,而流式很难超过20个marker,所以CyTOF可能发现流式难以观察到的一些价值信息。
CyTOF能检测什么样本?
组织和外周血都可以测,也可以直接提供细胞悬液或者细胞系。
CyTOF的样本要求有什么?
有细胞数量的要求,血样的细胞数量要达到3×10^6,而组织,消化后的细胞数量要达到1×10^6。此外,新鲜样本需要在取样后48小时内寄送至实验室。
样本如何寄送?
有标准的样本保存和运输手册。您只需按照我们提供的样本保存方法和寄送方式,在取样后48小时内寄送至实验室即可。